现已被禁用的有机砷、汞等农药， 由于其代谢产物砷、汞最终无法降解而残存于环境和植物体中。

六六六、滴滴涕等有机氯农药和它们的代谢产物化学性质稳定 ，在农作物及环境中消解缓慢，同时容易在人和动物体脂肪中积累。因而虽然有机氯农药及其代谢物毒性并不高， 但它们的残毒问题仍然存在。
有机磷、氨基甲酸酯类农药化学性质不稳定，在施用后，容 易受外界条件影响而分解。但有机磷和氨基甲酸酯类农药中存在着部分高毒和剧 毒品种，如甲胺磷、对硫磷 涕灭威、克百威、水胺硫磷等，如果被施用于生长期较短、连续采收的蔬菜，则很难避免因残留量超标而导致人畜中毒。

另外，一部分农药虽然本身毒性较低， 但其生产杂质或代谢物残 毒较高，如二硫代氨基甲酸酯类杀菌剂生产过程中产生的杂质及其代谢物乙撑硫脲属致癌物，三氯杀螨醇 中的杂质滴滴涕，丁硫克百威、丙硫克百威的主要代谢物克百威和3-羟基克百威等。

农药的内吸性、挥发性 、水溶性、 吸附性直接影响其在植物、 大气、水、土壤等周围环境中的残留。温度、光照、降雨量、土壤酸碱度及 有机质含量、植被情况/ 微生物等 环境因素也在不同程度上影响着农药的降解速度，影响农药残留。